# nf-core/sarek

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nf-core/sarek, dépôt open source à 616 étoiles sur GitHub. Carte Alpha de RepoMasters. Analysis pipeline to detect germline or somatic variants…

| Champ | Valeur |
| --- | --- |
| Propriétaire | [nf-core](https://repo.masters-masters.com/owners/nf-core) |
| Étoiles | 616 |
| Forks | 565 |
| Langage | [Nextflow](https://repo.masters-masters.com/languages/nextflow) |
| Licence | MIT |
| Création | 2019 |
| Sujets | nextflow, workflow, pipeline, bioinformatics, genomics, cancer, next-generation-sequencing, conda, reproducible-research, containers |
| Rang | [Alpha (250 à 699 ★)](https://repo.masters-masters.com/ranks/b_movie) |
| Voir sur GitHub | [nf-core/sarek](https://github.com/nf-core/sarek) |

## Fiche du dépôt

Analysis pipeline to detect germline or somatic variants (pre-processing, variant calling and annotation) from WGS / targeted sequencing

Rang des dépôts qui ont 250 à 699 ★ sur GitHub. Probabilité publiée par carte tirée : 20 %. Rareté : Peu commune.

## Autres dépôts de nf-core

- [nf-core/rnaseq · ★ 1 404 · Nextflow · Bêta](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/rnaseq)
- [nf-core/modules · ★ 435 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/modules)
- [nf-core/scrnaseq · ★ 364 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/scrnaseq)
- [nf-core/tools · ★ 329 · Python · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/tools)
- [nf-core/mag · ★ 326 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/mag)
- [nf-core/ampliseq · ★ 265 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/ampliseq)

## D’autres dépôts Nextflow

- [nf-core/rnaseq · ★ 1 404 · Nextflow · Bêta](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/rnaseq)
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- [nextflow-io/patterns · ★ 374 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nextflow-io/patterns)

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Données : GitHub · Illustration dessinée par RepoMasters à partir de l’identifiant du dépôt et de la couleur de son langage.
