# nf-core/scrnaseq

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nf-core/scrnaseq, dépôt open source à 364 étoiles sur GitHub. Carte Alpha de RepoMasters. Single-cell RNA-Seq pipeline for barcode-based protocols such as…

| Champ | Valeur |
| --- | --- |
| Propriétaire | [nf-core](https://repo.masters-masters.com/owners/nf-core) |
| Étoiles | 364 |
| Forks | 234 |
| Langage | [Nextflow](https://repo.masters-masters.com/languages/nextflow) |
| Licence | MIT |
| Création | 2019 |
| Sujets | nf-core, nextflow, workflow, pipeline, 10x-genomics, 10xgenomics, alevin, bustools, cellranger, kallisto |
| Rang | [Alpha (250 à 699 ★)](https://repo.masters-masters.com/ranks/b_movie) |
| Voir sur GitHub | [nf-core/scrnaseq](https://github.com/nf-core/scrnaseq) |

## Fiche du dépôt

Single-cell RNA-Seq pipeline for barcode-based protocols such as 10x, DropSeq or SmartSeq, offering a variety of aligners and empty-droplet detection

Rang des dépôts qui ont 250 à 699 ★ sur GitHub. Probabilité publiée par carte tirée : 20 %. Rareté : Peu commune.

## Autres dépôts de nf-core

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- [nf-core/modules · ★ 436 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/modules)
- [nf-core/tools · ★ 330 · Python · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/tools)
- [nf-core/mag · ★ 326 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/mag)
- [nf-core/ampliseq · ★ 265 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/ampliseq)

## D’autres dépôts Nextflow

- [bactopia/bactopia · ★ 526 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/bactopia/bactopia)
- [nf-core/modules · ★ 436 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nf-core/modules)
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- [BortonWrightonLabs/DRAM · ★ 343 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/BortonWrightonLabs/DRAM)
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- [nextflow-io/training · ★ 278 · Nextflow · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nextflow-io/training)

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Données : GitHub · Illustration dessinée par RepoMasters à partir de l’identifiant du dépôt et de la couleur de son langage.
