# refresh-bio/KMC

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refresh-bio/KMC, dépôt open source à 342 étoiles sur GitHub. Carte Alpha de RepoMasters. Fast and frugal disk based k-mer counter: counts 55-mers in 36…

| Champ | Valeur |
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| Propriétaire | [refresh-bio](https://repo.masters-masters.com/owners/refresh-bio) |
| Étoiles | 342 |
| Forks | 86 |
| Langage | [C++](https://repo.masters-masters.com/languages/c-plus-plus) |
| Licence | GPL-3.0 |
| Création | 2014 |
| Rang | [Alpha (250 à 699 ★)](https://repo.masters-masters.com/ranks/b_movie) |
| Voir sur GitHub | [refresh-bio/KMC](https://github.com/refresh-bio/KMC) |

## Fiche du dépôt

Fast and frugal disk based k-mer counter: counts 55-mers in 36 gzipped FASTQ files totaling 614 GB (WGS paired-end reads of NA12878, Illumina HiSeq 2000) in under 1.5 h, using 12 threads, 32 GB of RAM, and 389 GB of temporary disk, on a workstation with 2 Intel Xeon E5-2670 v3 CPUs (12 cores each a…

Rang des dépôts qui ont 250 à 699 ★ sur GitHub. Probabilité publiée par carte tirée : 20 %. Rareté : Peu commune.

## Autres dépôts de refresh-bio

- [refresh-bio/FAMSA · ★ 278 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/refresh-bio/FAMSA)
- [refresh-bio/agc · ★ 188 · C++ · Prototype](https://repo.masters-masters.com/repos/refresh-bio/agc)
- [refresh-bio/vclust · ★ 112 · Python · Prototype](https://repo.masters-masters.com/repos/refresh-bio/vclust)
- [refresh-bio/kmer-db · ★ 102 · C++ · Prototype](https://repo.masters-masters.com/repos/refresh-bio/kmer-db)

## D’autres dépôts C++

- [nathanshankar/terminal\_rviz · ★ 342 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/nathanshankar/terminal_rviz)
- [ethz-asl/BIEVR-LIO · ★ 342 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/ethz-asl/BIEVR-LIO)
- [saulob/dragons-crown-pro-pc · ★ 342 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/saulob/dragons-crown-pro-pc)
- [patriciogonzalezvivo/ofxFX · ★ 342 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/patriciogonzalezvivo/ofxFX)
- [strasdat/ScaViSLAM · ★ 342 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/strasdat/ScaViSLAM)
- [bewuethr/stroustrup-ppp · ★ 342 · C++ · Alpha](https://repo.masters-masters.com/repos/bewuethr/stroustrup-ppp)

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Données : GitHub · Illustration dessinée par RepoMasters à partir de l’identifiant du dépôt et de la couleur de son langage.